Троице-Сергиев Варницкий монастырь основан ростовским архиепископом Ефремом в 1427 году в Варницкой слободе на окраине города Ростова на месте рождения святого Русской православной церкви преподобного Сергия Радонежского (территория, занимаемая Троице-Сергиевым Варницким монастырём, в XIV веке входила в состав поместья Кирилла и Марии, родителей Сергия), спустя пять лет после причисления его к лику святых. Известный исследователь ростовских церковных древностей А. А. Титов писал: Благочестивые наши предки с целию увековечить в памяти грядущих поколений место родины великаго сподвижника земли русской, воздвигнув храм и обитель в Варницах Ростовских, в подражание основанной Сергием обители Троицкой, также назвали ее Троицкою. Что же касается до названия Варницкий, то оно присвоено монастырю потому, что до конца XVII столетия находились соляныя варницы.
Главный храм, как и в Троице-Сергиевой лавре, — Троицкий собор, впервые ставший каменным в 1763—1771 годах по желанию и на средства ростовского епископа Афанасия (Вольского). Главный престол посвящался Святой Троице, южный придел — преподобным Сергию и Никону Радонежским, северный придел — святителям Афанасию и Кириллу Александрийским. Освящение Троицкого собора епископ произвёл 16 октября 1771 года.
До 1764 года во главе Троице-Сергиева монастыря стояли игумены, после монастырской реформы оставленную за штатом обитель возглавляли строители.
Зимний храм, Введенская церковь, сооружена в 1826—1828 годы на деньги ростовских купцов. В 1919 году Троице-Сергиев монастырь был закрыт, а в последующие годы почти полностью разрушен. Был уничтожен Троицкий собор, ограда, жилые и хозяйственные строения, по территории проложена автомобильная дорога. Уцелели лишь Введенская церковь и несколько келейных корпусов.
Современное состояние С 1995 года началось восстановление монастыря. К настоящему времени архитектурный ансамбль монастыря отстроен заново. Возрождён Троицкий собор, отреставрирована и возобновлена Введенская церковь, над Святыми вратами построен храм в честь преподобных Кирилла и Марии, сооружены жилые, служебные и административные корпуса, возводится собор в честь Преподобного Сергия Радонежского. Ныне Троице-Сергиев Варницкий монастырь — подворье Свято-Троицкой Сергиевой лавры — состоит в непосредственном ведении Патриарха Московского и всея Руси Кирилла.
В обители действует православная гимназия и при ней пансион для учеников 10-го и 11-го классов.
